I samband med regionförvaltningsreformen koncentrerades alla färje- och förbindelsefartygsfrågor riksomfattande till Närings-, trafik- och miljöcentralen i Egentliga Finland.
Tidigare hade Åbo vägdistrikt hand om frågor i anknytning till landsvägsfärjorna och Sjöfartsverket frågor i anknytning till förbindelsefartygstrafiken, medan tre länsstyrelser hade ansvaret för tillstånd gällande förkörsrätt.